Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms