Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms