Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms