Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf1Q9Z1B8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms