Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms