Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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