Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slit3Q9WVB4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms