Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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