Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB7

Clcnka, Chloride channel protein ClC-Ka, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkaQ9WUB7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClcnkaQ9WUB7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ClcnkaQ9WUB7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms