Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lemd3Q9WU40 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lemd3Q9WU40 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lemd3Q9WU40 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lemd3Q9WU40 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Lemd3Q9WU40 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lemd3Q9WU40 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lemd3Q9WU40 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lemd3Q9WU40 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lemd3Q9WU40 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lemd3Q9WU40 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lemd3Q9WU40 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lemd3Q9WU40 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms