Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms