Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skp1Q9WTX5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms