Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc2Q9R244 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms