Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TapbpQ9R233 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TapbpQ9R233 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TapbpQ9R233 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TapbpQ9R233 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TapbpQ9R233 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TapbpQ9R233 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TapbpQ9R233 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TapbpQ9R233 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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TapbpQ9R233 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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