Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6ap1Q9R1Q9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6ap1Q9R1Q9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms