Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms