Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0X0

Med20, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med20Q9R0X0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Med20Q9R0X0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med20Q9R0X0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms