Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms