Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms