Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp11cQ9QZW0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms