Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Usp21Q9QZL6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Usp21Q9QZL6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Usp21Q9QZL6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Usp21Q9QZL6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Usp21Q9QZL6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Usp21Q9QZL6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Usp21Q9QZL6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Usp21Q9QZL6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Usp21Q9QZL6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Usp21Q9QZL6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Usp21Q9QZL6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp21Q9QZL6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms