Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms