Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms