Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.7 ms