Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp3Q9QY23 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms