Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX0

Jag1, Protein jagged-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jag1Q9QXX0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Jag1Q9QXX0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jag1Q9QXX0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms