Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms