Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpsf3Q9QXK7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms