Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad18Q9QXK2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms