Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms