Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Trpc5Q9QX29 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Trpc5Q9QX29 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Trpc5Q9QX29 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Trpc5Q9QX29 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Trpc5Q9QX29 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Trpc5Q9QX29 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Trpc5Q9QX29 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Trpc5Q9QX29 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Trpc5Q9QX29 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Trpc5Q9QX29 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Trpc5Q9QX29 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Trpc5Q9QX29 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Trpc5Q9QX29 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Trpc5Q9QX29 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Trpc5Q9QX29 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trpc5Q9QX29 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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Trpc5Q9QX29 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trpc5Q9QX29 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trpc5Q9QX29 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpc5Q9QX29 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpc5Q9QX29 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpc5Q9QX29 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpc5Q9QX29 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpc5Q9QX29 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpc5Q9QX29 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpc5Q9QX29 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpc5Q9QX29 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpc5Q9QX29 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpc5Q9QX29 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpc5Q9QX29 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpc5Q9QX29 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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