Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Clca3a1Q9QX15 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms