Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms