Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc2lQ9JME7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms