Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Prg4Q9JM99 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Prg4Q9JM99 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Prg4Q9JM99 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Prg4Q9JM99 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Prg4Q9JM99 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Prg4Q9JM99 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Prg4Q9JM99 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Prg4Q9JM99 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Prg4Q9JM99 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Prg4Q9JM99 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Prg4Q9JM99 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Prg4Q9JM99 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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