Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SrfQ9JM73 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms