Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col5a3Q9JLI2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms