Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms