Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Tgm1Q9JLF6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Tgm1Q9JLF6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Tgm1Q9JLF6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Tgm1Q9JLF6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Tgm1Q9JLF6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tgm1Q9JLF6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tgm1Q9JLF6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tgm1Q9JLF6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tgm1Q9JLF6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tgm1Q9JLF6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms