Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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SacsQ9JLC8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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SacsQ9JLC8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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