Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms