Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms