Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms