Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms