Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms