Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms