Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssna1Q9JJ94 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssna1Q9JJ94 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssna1Q9JJ94 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssna1Q9JJ94 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssna1Q9JJ94 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssna1Q9JJ94 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssna1Q9JJ94 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssna1Q9JJ94 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssna1Q9JJ94 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssna1Q9JJ94 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssna1Q9JJ94 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssna1Q9JJ94 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssna1Q9JJ94 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssna1Q9JJ94 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssna1Q9JJ94 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssna1Q9JJ94 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssna1Q9JJ94 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssna1Q9JJ94 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ssna1Q9JJ94 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ssna1Q9JJ94 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ssna1Q9JJ94 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ssna1Q9JJ94 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ssna1Q9JJ94 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ssna1Q9JJ94 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ssna1Q9JJ94 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ssna1Q9JJ94 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ssna1Q9JJ94 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ssna1Q9JJ94 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssna1Q9JJ94 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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