Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc86Q9JJ89 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms