Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms