Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tulp4Q9JIL5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tulp4Q9JIL5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms